pufff.... de esto no estoy muy puesto, en motos solo he puesto una a punto y no me dio problemas. entiendo que aparte del numero de bulones como tu dices, tendrias que tener una referencia de en que posicion se colaca cada uno de esos dos ejes (los arboles de levas) puesto que lo importante es la posicion en la que queda cada uno. mira bien el manual, pues lo suyo es que tanto el cigueñal como los arboles de levas, queden en una posicion determinada y que ademas coincida como tu dices con el numero de bulones que hay entre ambas marcas, si no es asi la moto quedara adelantada o atrasada de punto lo que en el mejor de los casos hara que no arranque bien como dices, pero es que podrias llegar a fastidiar el motor si tocan los pistones con las valvulas por el desfase en la distribucion... pon a punto todos los parametros y siempre antes de arrancar haz girar la distribucion a mano para ver que despues de varias vueltas las marcas continuan coincidiendo o corres el riesgo de liarla...PARDA.