Hola acabo de comprar una GSXR 1000 modelo 2011 y note que después de un tiempo prende el FI, la apagó y vuelvo a prender y todo normal pero al poco rato vuelve a encender.

Alguna solución o manual que me ayude a repararlo. 

es raro que con los escapes de serie, te esté marcando el FI, normalmente suele hacerlo cuando se cambian los escapes, el filtro de aire, etc... también puedes tener un problema con el servomotor, que no te esté haciendo bien el juego o tenga algún fallo...

yo tenía la misma moto, pero del 2009, le cambié los dos escapes por el escape de la 2012, que lleva sólo uno (por cierto, todavía lo tengo en casa a la venta, colectores y escape)... tuve que anular el servomotor para que no apareciera el famoso FI...

en el apartado de tutoriales, tienes un montón sobre el tema, yo he subido varios tutoriales explicativos, a ver si te sirven alguno de ellos...